En algunos casos de virus Windows no se inicia o no lo hace de manera normal, si este es tu caso no todo está perdido, aún hay posibilidades de limpiar de virus tu PC usando un disco de rescate, existen varios discos de rescate, pero te voy a recomendar uno que es gratuito de la marca AVG famosa por su antivirus gratis, dicho CD de rescate se llama AVG Rescue CD y no precisamente se puede usar desde CD ya que también tiene versión para memoria USB.
Básicamente para lo que nos sirve este CD de rescate de AVG es para iniciar tu computadora con este CD y analizar tu disco duro en busca de problemas y virus y repararlos para después poder iniciar Windows, así que lo primero que tienes que hacer para usar este CD de rescate es descargar la imagen ISO del CD y después grabar el ISO a un CD.
Una vez que tengas tu CD ya grabado debes introducirlos en el lector de tu PC e inicias la PC presionando la tecla necesaria para arrancar desde el CD (cómo arrancar la PC desde un CD), una vez que inice el CD de rescate verás algunas opciones como en la imagen anterior, la primera opción es para analizar en busca de virus.
Si ya tienes un CD de rescate de AVG, te recomiendo darte una vuelta por la página de descargas del CD ya que es muy importante tener la versión más reciente para que la limpieza de virus sea más efectiva.
Enlace para descargar la imagen ISO de AVG Rescue CD.