El iPod y el iPhone tienen la capacidad de reproducir videos en formato .mp4 pero estos videos pueden tener varios audios, por ejemplo para una película la puedes tener en español y en inglés en el mismo archivo y tú desde el iPod y iPhone podrás elegir facilmente el audio que deseas escuchar, lo mismo pasa con los capítulos, puedes ver una película y cambiar de capítulo a capítulo fácilmente.
Pero las películas con capítulos compatibles con el iPod y iPhone son sólo las que has comprado con desde la iTunes Store o las que has rippeado desde un DVD usando Handbrake que es un excelente rippeador y conversor de video que ya había recomendado antes, pero ¿cómo capitular un video que has creado tu mismo o que has bajado de Internet? existe un truco que me recomendó Áaron Barraza @aebs que es muy sencillo, no voy a explicarlo paso a paso pero pondré un video donde lo explican muy bien.
Add Chapters To Your IPod Movies! – Funny bloopers R us
Otro método para agregar capítulos y sólo para usuarios de Mac es usar un software llamado MovieChapterizer, que es un programa que facilita en gran medida el proceso manual de agregar en archivos de texto los nombres de los capítulos cómo en el video anterior, lo malo es que este software es de pago pero puedes descargar un demo.
Enlace para descargar el demo de MovieChapterizer.