Con un script hecho en PHP llamado XtraUpload puedes montar un sitio como RapidShare en tu propio servidor web, XtraUpload es un script gratuito que descubrí en Web Resorces Depot y que está desarrollado a partir del framework CodeIgniter, además necesita una base de datos MySQL.
Una de las características más llamativas de XtraUpload es que tiene la podibilidad de ofrecer 2 tipos de descargar para tus usuarios, una gratuita y una de pago, así podrás monetizar el servicio así como lo hacen en rapidshare.com y megaupload.com, de hecho puede ver un demo de XtraUpload.
Además los usuarios podrán subir múltiples archivos, crear y proteger con contraseña las carpetas, calificar los archivos y compartir enlaces vía e-mail y más.
Enlace para descargar XtraUpload.